Roderick MacKinnon, (γεννημένος στις 19 Φεβρουαρίου 1956, Μπέρλινγκτον, Μασαχουσέτη, ΗΠΑ), Αμερικανός γιατρός, αποδέκτης του βραβείου Νόμπελ Χημείας το 2003 για την πρωτοποριακή του έρευνα σχετικά με τα κανάλια ιόντων στις κυτταρικές μεμβράνες. Μοιράστηκε το βραβείο με τον Peter Agre, επίσης από τις Ηνωμένες Πολιτείες.
Ο MacKinnon απέκτησε πτυχίο MD από την Ιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου Tufts το 1982. Αφού ασκούσε ιατρική για αρκετά χρόνια, στράφηκε στη βασική έρευνα, ξεκινώντας το 1986 με μεταδιδακτορική εργασία σε κανάλια ιόντων στο Πανεπιστήμιο Brandeis. Το 1989 έγινε μέλος του Πανεπιστημίου του Χάρβαρντ και το 1996 μετακόμισε στο Πανεπιστήμιο Rockefeller ως καθηγητής και επικεφαλής εργαστηρίου. Ένα χρόνο αργότερα διορίστηκε ερευνητής στο Rockefeller του Ιατρικού Ινστιτούτου Howard Hughes.
Ιδιαίτερης σημασίας για το νευρικό σύστημα και την καρδιά, τα κανάλια ιόντων είναι εξειδικευμένα ανοίγματα σε κυτταρικές μεμβράνες που επιτρέπουν στα ιόντα, όπως το κάλιο και το νάτριο, να ρέουν εύκολα μέσα και έξω από τα κύτταρα. παρόμοιες δομές υπάρχουν επίσης για τη διέλευση του νερού. Η πρωτοποριακή εργασία του MacKinnon επικεντρώθηκε στα "φίλτρα" σε κανάλια που πέρασαν έναν τύπο ιόντος ενώ μπλοκάρουν άλλους. Για να καταλάβει πώς λειτουργούν αυτά τα φίλτρα, έλαβε ευκρινέστερες εικόνες καναλιών χρησιμοποιώντας περίθλαση ακτίνων Χ. Το 1998 καθόρισε την τρισδιάστατη μοριακή δομή ενός καναλιού ιόντων. Το κανάλι, ανακάλυψε ο MacKinnon, έχει μια αρχιτεκτονική μεγέθους με τρόπο που αφαιρεί εύκολα τα ιόντα καλίου - αλλά όχι τα ιόντα νατρίου - των σχετικών μορίων του νερού και τους επιτρέπει να περάσουν. Βρήκε επίσης έναν μοριακό «αισθητήρα» στο τέλος του καναλιού που βρίσκεται πλησιέστερα στο εσωτερικό του κελιού που αντιδρά σε συνθήκες γύρω από το κελί, στέλνοντας σήματα που ανοίγουν και κλείνουν το κανάλι στις κατάλληλες στιγμές. Το πρωτοποριακό του έργο επέτρεψε στους επιστήμονες να συνεχίσουν την ανάπτυξη φαρμάκων για ασθένειες στις οποίες τα κανάλια ιόντων παίζουν ρόλο.
