Χρωματογραφία γέλης, που ονομάζεται επίσης Διήθηση Gel, στην αναλυτική χημεία, τεχνική διαχωρισμού χημικών ουσιών με την εκμετάλλευση των διαφορών στους ρυθμούς με τους οποίους διέρχονται από ένα στρώμα πορώδους, ημιστερεάς ουσίας. Η μέθοδος είναι ιδιαίτερα χρήσιμη για το διαχωρισμό ενζύμων, πρωτεϊνών, πεπτιδίων και αμινοξέων μεταξύ τους και από ουσίες χαμηλού μοριακού βάρους. Ο διαχωρισμός των συστατικών ενός μίγματος με χρωματογραφία γέλης βασίζεται στις διαφορές στα μοριακά μεγέθη των συστατικών. Τα μικρά μόρια τείνουν να διαχέονται στο εσωτερικό των πορωδών σωματιδίων έτσι ώστε η ροή τους να είναι περιορισμένη, ενώ μεγάλα μόρια δεν μπορούν να εισέλθουν στους πόρους και τείνουν να ρέουν ανεμπόδιστα. Έτσι, τα συστατικά με το υψηλότερο μοριακό βάρος αφήνουν πρώτα την κλίνη, ακολουθούμενη από διαδοχικά μικρότερα μόρια. Τα υλικά κλίνης που χρησιμοποιούνται ευρέως είναι πολυακρυλαμίδιο και ένα πολυμερές παρασκευασμένο από δεξτράνη και επιχλωροϋδρίνη. Τα ξηρά πολυμερή συνήθως εναιωρούνται σε κατάλληλους παράγοντες για να σχηματίσουν ένα ομοιογενές, ημιστερεό μείγμα.
