John Cotton, (γεννημένος στις 4 Δεκεμβρίου 1585, Derby, Derbyshire, Eng. — meninggal 23 Δεκεμβρίου 1652, Boston, Mass. [US]), επιδραστικός ηγέτης της Πουριτανίας της Νέας Αγγλίας που υπηρέτησε κυρίως ως «δάσκαλος» της Πρώτης Εκκλησίας του Βοστώνη (1633–52) μετά την αποφυγή της δίωξης των μη συμμορφωτών από την Εκκλησία της Αγγλίας.
Σπούδασε στο Trinity College του Κέιμπριτζ, ο Cotton έγινε εκπρόσωπος της ενοριακής εκκλησίας του St. Botolph στη Βοστώνη, στο Λίνκολνσαϊρ, το 1612 και παρέμεινε στη θέση αυτή για 21 χρόνια. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου σταδιακά έγινε πιο Πουριτανός στην προοπτική του, και σταμάτησε να παρακολουθεί ορισμένα αγγλικανικά θρησκευτικά τελετουργικά κατά την εκτέλεση των καθηκόντων του. Το 1632 αναλήφθηκε νομική δίωξη εναντίον του για τη μη συμμόρφωση του, και τον Ιούλιο του 1633 μετανάστευσε στην αποικία της Μασαχουσέτης, όπου έγινε «δάσκαλος» της Πρώτης Εκκλησίας της Βοστώνης, παραμένοντας έτσι μέχρι το θάνατό του. Η δημοτικότητά του στην αποικία ήταν απεριόριστη και η επιρροή του τόσο σε αστικές όσο και σε εκκλησιαστικές υποθέσεις ήταν πιθανώς μεγαλύτερη από οποιαδήποτε άλλη υπουργό στη θεοκρατική Νέα Αγγλία.
Ο Cotton έγραψε διάφορα έργα που αποτελούν μια ανεκτίμητη έκθεση του Congregationalism της Νέας Αγγλίας, συμπεριλαμβανομένων των The Way of the Churches of Christ in New England (1645) και The Way of Congregational Churches Cleared (1648). Ο κατεχισμός που έγραψε, Milk for Babes, Drawn out of the Breasts of Both Testaments (1646), χρησιμοποιήθηκε ευρέως για πολλά χρόνια στη Νέα Αγγλία για τη θρησκευτική εκπαίδευση των παιδιών.
