Διαμόρφωση, οποιοσδήποτε από τον άπειρο αριθμό πιθανών χωρικών διατάξεων ατόμων σε ένα μόριο που προκύπτει από την περιστροφή των συστατικών του ομάδων ατόμων σχετικά με τους απλούς δεσμούς.
πρωτεΐνη: Διαμόρφωση πρωτεϊνών σε διεπαφές
Όπως πολλές άλλες ουσίες με υδρόφιλες και υδρόφοβες ομάδες, οι διαλυτές πρωτεΐνες τείνουν να μεταναστεύουν στη διεπαφή μεταξύ του αέρα
Διαφορετικές διαμορφώσεις είναι δυνατές για οποιοδήποτε μόριο στο οποίο ένας απλός ομοιοπολικός δεσμός συνδέει δύο πολυατομικές ομάδες, σε κάθε μία από τις οποίες τουλάχιστον ένα άτομο δεν βρίσκεται κατά μήκος του άξονα του συγκεκριμένου δεσμού. Το απλούστερο τέτοιο μόριο είναι εκείνο του υπεροξειδίου του υδρογόνου, στο οποίο οι δύο υδροξυλομάδες μπορούν να περιστρέφονται το ένα σε σχέση με τον άξονα του δεσμού οξυγόνου-οξυγόνου. Η παρουσία περισσότερων από μία τέτοιες απλό δεσμό σε ένα μόριο-όπως το ότι του προπανίου (CH 3 -CH 2 -CH 3), για παράδειγμα-απλώς προσθέτει στην πολυπλοκότητα της κατάστασης χωρίς να αλλάζει τη φύση της. Σε μόρια όπως αυτά του κυανογόνου (N≡C ― C≡N) ή butadiyne (H ― C≡C ― C≡C ― H), όλα τα άτομα βρίσκονται κατά μήκος του άξονα του κεντρικού ενιαίου δεσμού, έτσι ώστε να μην διακρίνονται διαμορφώσεις υπάρχει.
Γενικά, κάθε διακριτή διαμόρφωση ενός μορίου αντιπροσωπεύει μια κατάσταση διαφορετικής δυναμικής ενέργειας λόγω της λειτουργίας ελκυστικών ή απωθητικών δυνάμεων που ποικίλλουν ανάλογα με τις αποστάσεις μεταξύ διαφορετικών τμημάτων της δομής. Εάν αυτές οι δυνάμεις απουσίαζαν, όλες οι διαμορφώσεις θα είχαν την ίδια ενέργεια και η περιστροφή γύρω από τον μονό δεσμό θα ήταν εντελώς ελεύθερη ή χωρίς περιορισμούς. Εάν οι δυνάμεις είναι ισχυρές, διαφορετικές διαμορφώσεις διαφέρουν πολύ στην ενέργεια ή τη σταθερότητα: το μόριο καταλαμβάνει κανονικά μια σταθερή κατάσταση (μία χαμηλής ενέργειας) και θα υποβληθεί σε μετάβαση σε μια άλλη σταθερή κατάσταση μόνο όταν απορροφήσει αρκετή ενέργεια για να φτάσει και να περάσει από την ασταθή παρεμβολή διαμόρφωση.
Οι ενδομοριακές δυνάμεις στο αιθάνιο, για παράδειγμα, είναι τόσο αδύναμες που η ύπαρξή τους μπορεί να συναχθεί μόνο από λεπτές επιδράσεις σε θερμοδυναμικές ιδιότητες όπως η ενθαλπία και η εντροπία. (Ακόμα κι αν η εσωτερική περιστροφή σε αιθάνιο ήταν αυστηρά περιορισμένη, οι τρεις πιο σταθερές διαμορφώσεις του δεν διακρίνονται.) Οι μοριακές δομές ορισμένων πιο σύνθετων ενώσεων, ωστόσο, επιβάλλουν τόσο ισχυρά εμπόδια στην περιστροφή που οι στερεοϊσομερείς μορφές - που διαφέρουν μόνο σε διαμόρφωση - είναι αρκετά σταθερές ώστε να απομονωθεί.
