Ο απελευθερωτικός αγώνας στην Τανγκανίκα ηγήθηκε της Αφγανικής Εθνικής Ένωσης της Τανγκανίκα, της οποίας η σημαία ήταν οριζόντια τρίχρωμη πράσινη-μαύρη-πράσινη. Οι εκλογές επιβεβαίωσαν τη συντριπτική λαϊκή υποστήριξη για την οργάνωση, και οι βρετανικές αρχές πρότειναν να τροποποιηθεί η σημαία του κόμματος για χρήση ως εθνική σημαία μετά την ανεξαρτησία στις 9 Δεκεμβρίου 1961. Προστέθηκαν κίτρινες εκδηλώσεις εκείνη την εποχή.
Κάτω από τον αραβικό κανόνα, η Ζανζιβάρη είχε από καιρό φέρει κόκκινη σημαία, αλλά ένα μαύρο αφρικανικό καθεστώς ήρθε στην εξουσία στις 12 Ιανουαρίου 1964, υπό μια σημαία μαύρου, κίτρινου και μπλε. Τον επόμενο μήνα, το κυβερνών κόμμα Afro-Shirazi εισήγαγε μια νέα εθνική σημαία παρόμοια με τη δική της. Οι οριζόντιες μπλε-μαύρες-πράσινες ρίγες αντιστοιχούσαν στη θάλασσα, στους ανθρώπους και στη γη, αντίστοιχα, ενώ μια στενή άσπρη κάθετη λωρίδα στο ανυψωτικό ήταν για ειρήνη.
Τον Απρίλιο του 1964, οι χώρες της Τανγκανίκα και της Ζανζιβάρης ενώθηκαν, και στις αρχές Ιουλίου οι παραδόσεις της σημαίας τους συγχωνεύτηκαν για να δημιουργήσουν τη νέα εθνική σημαία της Τανζανίας. Τα χρώματα της σημαίας ενσωματώθηκαν διαγώνια για διακριτικότητα. Ο περισσότερος πληθυσμός της χώρας συμβολίζεται από τη μαύρη λωρίδα, ενώ το πράσινο δείχνει τους πλούσιους γεωργικούς πόρους της γης. Ο ορυκτός πλούτος αντανακλάται στα στενά κίτρινα σύνορα, ενώ ο Ινδικός Ωκεανός συμβολίζεται με μπλε. Αφού η Ζανζιβάρη ενώθηκε με την Τανγκανίκα, η σημαία της Ζανζιβάρης συνέχισε να χρησιμοποιείται τοπικά σε αυτά τα νησιά.
